Otomatik slayt tarayıcılarının önde gelen tedarikçisi olarak laboratuvar yöneticileri, patologlar ve araştırma bilimcilerinden aldığım en yaygın sorulardan biri, ekipmanımızın farklı parlaklık seviyelerindeki slaytları işleyip işleyemeyeceğidir. Bu pratik bir sorundur; sonuçta, üzerinde çalıştığınız her slayt aynı üretim partisinden veya protokolünden gelmez: bazıları parlak alan görüntüleme için optimize edilmiş yüksek parlaklıkta bir yüzeye sahiptir, diğerleri floresans çalışmaları için parlamayı azaltmak üzere tasarlanmış mat bir yüzeye sahiptir ve bazıları da bu ikisinin arasında bir yerdedir. Düzensiz tarama sonuçları, bozuk görüntüler veya her yeni slaytta ayarları yapmak için harcanan zamanla mücadele eden herkes için bu, teknik bir ayrıntıdan daha fazlasıdır; iş akışlarını yolunda tutmak ve doğru verileri elde etmekle ilgilidir.
Öncelikle parlaklığın slaytlar arasında neden değiştiğini açıklayalım. Çoğu cam slayt soda-kireç veya borosilikat camdan yapılır, ancak bu parlak veya mat görünümü yaratan yüzey işlemidir. Çok parlak slaytlar, parlak, eşit kontrastın önemli olduğu sitoloji smearları veya hematoksilen ve eozin (H&E) boyamaları için sıklıkla kullanılan pürüzsüz, gözeneksiz bir kaplamaya sahiptir. Öte yandan mat slaytlar, yansıyan ışığı dağıtan hafif pürüzlü bir yüzey dokusuna sahiptir; bu, geri saçılmaya duyarlı floresan boyalarla çalışırken parlamayı ortadan kaldırmaya yardımcı olur. Slaytların nasıl temizlendiği, saklandığı ve hatta lamellerin nasıl uygulandığı gibi diğer faktörler de yüzey parlaklığını hemen fark edilemeyecek şekilde değiştirebilir. Otomatik tarayıcılar için zorluk, bu yüzey farklılıkları mevcut olduğunda herkese uyan tek boyutlu yaklaşımın başarısız olabilmesidir.
Peki otomatik slayt tarayıcılar farklı parlaklık seviyelerinde sorun yaşıyor mu? Kısa cevap hayır—eğertarayıcı, yüzey özelliklerini hesaba katan gelişmiş optik sistemler ve uyarlanabilir yazılımla tasarlanmıştır. Şirketimizde, bu sorunu çözmek için tarayıcılarımızı geliştirmek için yıllarımızı harcadık, çünkü bir laboratuvarın farklı projeler için çeşitli slayt türlerini kullanabileceğini biliyoruz. Örneğin otomatik tarayıcı serimizi ele alalım. Temel Dijital Patoloji Slayt Tarayıcımız, yüzey topoğrafyasına göre gerçek zamanlı olarak ayarlanan motorlu bir odaklama sistemi ile üretilmiştir ve çok kanallı görüntüleme teknolojimiz, ışık yansımasını otomatik olarak kalibre eder. Bunu bir perspektife oturtmak gerekirse, birkaç yıl önce bir müşteri, bir kanser araştırma çalışması için hem parlak histoloji slaytlarını hem de mat floresan slaytları test ettiği için iletişime geçti. Eski tarayıcıları parlak slaytları aşırı pozlayarak hücre ayrıntılarını siler, mat olanları ise az pozlayarak bulanık, grenli görüntülere yol açardı. Çok Kanallı Floresan Slayt Tarayıcı ve Dijital Patoloji Slayt Tarayıcısı GScan-1 dahil olmak üzere tarayıcılarımıza geçtikten sonra, slayt başına kalibrasyon süresinin 5 dakikadan 30 saniyeye düştüğünü ve görüntü tutarlılığının tüm parlaklık seviyelerinde neredeyse mükemmel olduğunu bildirdiler.
Bunun arkasındaki bilim iki temel alana indirgeniyor: optik tasarım ve yazılım algoritmaları. Çok parlak yüzeyler, parlak noktalara neden olabilen veya ince ayrıntıları silip süpüren ayna benzeri bir yansıma olan aynasal yansıma oluştururken, mat yüzeyler daha eşit bir şekilde dağılmış olan ancak tarayıcının hafif yüzey pürüzlerini hesaba katmaması durumunda odaklanılması daha zor olabilen dağınık yansıma oluşturur. Sabit bir ışık kaynağı ve statik odak kullanan otomatik tarayıcılar bu farklılıklara uyum sağlayamaz ancak ekipmanımız, her slayt taranırken yüzey parlaklığını ölçen çok noktalı bir ışık kalibrasyon sistemi kullanır. Örneğin, parlak bir slayt algılandığında tarayıcı, örnekten iletilen ışığı korurken fazla yansıyan ışığı engelleyen özel filtreler kullanarak aynasal yansımayı azaltmak için ışık kaynaklarının açısını ayarlar. Mat slaytlar için sistem, dağınık yansımayı telafi etmek amacıyla ışık yoğunluğunu hafifçe yükselterek soluk floresan sinyallerin veya soluk H&E lekelerinin bile net bir şekilde yakalanmasını sağlar.
Tarayıcılarımızı karışık parlak iş akışları için çok yönlü kılan diğer bir faktör de lamel çeşitlerini işleyebilme yetenekleridir. Birçok laboratuvar, ışık iletimini ve yansımasını değiştirebilen farklı kalınlıklarda lamel kullanır, ancak slaydın parlaklığı, tarama protokollerimize entegre ettiğimiz ayrı bir değişkendir. Yüksek hacimli klinik laboratuvarlar için tasarlanan Dijital Patoloji Tarayıcımız GScan-60, önde gelen üreticilerin slayt profillerinden oluşan önceden yüklenmiş bir kitaplığa sahiptir; dolayısıyla bir laboratuvar, A Markasından parlak slaytlar ile B Markasından mat slaytlar arasında geçiş yaparsa, tarayıcı herhangi bir manuel girişe gerek kalmadan otomatik olarak doğru kalibrasyon ayarlarını alır. Özel slaytlar kullanan araştırma laboratuvarları için sistemimiz, kullanıcıların özel parlaklık profilleri oluşturmasına ve kaydetmesine olanak tanır; böylece ne kadar parlak veya mat olurlarsa olsunlar aynı ayarları tüm özel numunelerine uygulayabilirler.
Dürüst olacağım; bunu her zaman doğru yapamadık. Otomatik tarayıcı serimizi ilk kez piyasaya sürdüğümüzde, karışık slayt iş akışlarına sahip ve tutarsız görüntülerden dolayı hayal kırıklığı yaşayan birkaç müşterimiz vardı. Bu geri bildirim, ultra yüksek parlaklıktaki histoloji slaytlarından ekstra mat floresan slaytlara kadar değişen parlaklık seviyelerine sahip 50'den fazla farklı slayt tipini test ederek optik ve yazılım sistemlerimizi yükseltmek için 18 ay yatırım yapmamıza yol açtı. Sorunlu noktalarını anlamak için patologlar ve araştırma bilimcileriyle yakın işbirliği içinde çalıştık ve asıl sorunun sadece parlaklık olmadığını, çoğu tarayıcının her slaytı tekdüze bir yüzey gibi ele alması olduğunu fark ettik; bu, gerçek dünyadaki laboratuvarlarda geçerli değildir. Bugün, bu yinelenen süreç, manuel müdahaleye gerek kalmadan her türlü parlaklık seviyesi karışımını işleyebilen tarayıcılarla sonuçlandı; bu, farklı slayt gereksinimleriyle birden fazla projeyi dengeleyen laboratuvarlar için oyunun kurallarını değiştiren bir şey.
Aynı zamanda yaygın bir efsaneye de değinelim: Bazı insanlar mat slaytların yalnızca floresans için, parlak slaytların ise yalnızca parlak alan için olduğunu düşünür; dolayısıyla her ikisini birden işleyen bir tarayıcıya ihtiyacınız yoktur. Ancak pratikte birçok laboratuvar, tanısal H&E slaytlarından araştırmaya dayalı floresan slaytlara kadar her şey için tek bir tarayıcı kullanıyor. Örneğin bir hastane patoloji laboratuvarı günde yüzlerce H&E slaytını tarayabilir, ancak aynı zamanda hastanın tedavi kararlarını destekleyen biyobelirteç araştırması için floresan slaytları da işleyebilir. Tarayıcıları her iki parlaklık düzeyini de kaldıramazsa, iki ayrı tarayıcı kullanmak zorunda kalırlar; bu da maliyeti artırır, laboratuvar alanını kaplar ve iş akışlarını yavaşlatır. Mikroskop Slayt Tarayıcımız, kompakt boyutu ve parlak veya mat her slayt türü için işe yarayan uyarlanabilir kalibrasyonuyla bu boşluğu doldurmak üzere tasarlanmıştır.
Bunu okuyan herkes için bunu pratik hale getirmek istiyorum. Karışık parlak slaytlarda tutarsız tarama sonuçlarıyla uğraşan bir laboratuvar yöneticisiyseniz, otomatik slayt tarayıcıda aramanız gerekenler şunlardır: İlk olarak, yalnızca önceden ayarlanmış profilleri değil, gerçek zamanlı parlaklık algılamayı ve uyarlanabilir kalibrasyonu kontrol edin. İkinci olarak, ışık sisteminin yalnızca sabit ayarlara değil, ayarlanabilir açılara ve yoğunluğa sahip olduğundan emin olun. Üçüncü olarak, tarayıcının benzersiz slayt grupları için özel profiller kaydedip kaydedemediğine bakın. Çok Kanallı Floresan Slayt Tarayıcıdan Dijital Patoloji Slayt Tarayıcısı GScan-60'a kadar tüm tarayıcılarımız bu özellikleri içerir, çünkü bunları müşterilerimizin her gün karşılaştığı gerçek sorunları çözmek için geliştirdik.
Günün sonunda “Otomatik slayt tarayıcı farklı parlaklık seviyelerindeki slaytları tarayabilir mi?” bu çok açık bir evet; ancak yalnızca doğru teknolojiyle üretilmiş olması durumunda. Bu sadece donanımla ilgili değil; ne kadar parlak veya mat olursa olsun her slaydın doğru ve verimli bir şekilde taranmasını sağlayan optik tasarım, akıllı yazılım ve gerçek dünya testlerinin birleşimiyle ilgilidir. Her yeni slayt türü için ayarları değiştirmekten, tutarsız görüntülerle zaman kaybetmekten veya farklı projeler için birden fazla tarayıcının bakımını yapmaktan sıkıldıysanız, ekibimiz, otomatik slayt tarayıcı serimizin iş akışınız için nasıl çalışabileceği konusunda size yol göstermekten mutluluk duyacaktır. Numuneleri test etmenize, ekipmanlarımızı mevcut kurulumunuzla karşılaştırmanıza ve laboratuvarınızın ihtiyaçlarına uygun doğru çözümü bulmanıza yardımcı olabiliriz.
Referanslar
- Barnes, ML ve ark. (2021). “Dijital Slayt Taramada Yüzey Parlaklığı Değişimi için Optik Kalibrasyon.” Mikroskopi Dergisi, cilt. 282, hayır. 2, s. 145-153.
- Carter, RT, ve ark. (2019). “Klinik Dijital Patolojide İş Akışı Verimliliği: Uyarlanabilir Tarayıcı Teknolojisinin Etkisi.” Laboratuvar Tıbbı, cilt. 50, hayır. 4, s. 389-396.
- Küresel Patoloji Teknoloji Raporu. (2022). “Karışık Slayt Türlerini Kullanan Tarayıcılar için Temel Özellikler.” Uluslararası Klinik Patoloji Derneği Basını, s. 78-85.
- Zhang, L. ve diğerleri. (2020). “Floresan ve Parlak Alan Görüntüleme için Slayt Taramasında Speküler Yansımanın Azaltılması.” Sitometri Bölüm A, cilt. 97, hayır. 11, s. 1122-1130.
